在农村土地流转的实践中，用益物权的处分权问题逐渐成为焦点，尤其是在合作社模式下，如何有效行使与限制这一权利，关系到农民的切身利益和农村经济的可持续发展。

用益物权，作为他物权的一种，旨在对他人之物进行使用和收益。在农村土地流转中，农民通过土地承包经营权入股合作社，实际上是将用益物权中的部分权利让渡给合作社行使。这种模式下，农民不仅可以继续享有土地的基本收益权，还能通过合作社的规模化经营获得额外收益。然而，用益物权的处分权并非毫无限制，其行使必须在法律框架内进行。

首先，用益物权的处分权在合作社模式下表现为土地经营权的流转。农民将土地承包经营权入股合作社，实际上是一种权利的再分配过程。在这一过程中，农民仍然保留对土地的基本权利，如承包权和最终的处置权，而将经营权交由合作社行使。这种权利的让渡需要通过合同明确约定，确保双方的权利义务清晰明了。

其次，合作社在行使用益物权的处分权时，必须遵循合法合规的原则。合作社作为集体经济组织的一种形式，其行为不仅要符合《中华人民共和国农民专业合作社法》，还需符合土地管理法、农村土地承包法等相关法律法规。特别是在土地用途变更和土地再流转等问题上，合作社必须严格遵守法律规定，不得擅自改变土地的农业用途或进行非法转包。

同时，用益物权的处分权在合作社模式下也受到一定的限制。首先，农民作为土地承包经营权的原始权利人，其基本权益必须得到保障。合作社在经营过程中，必须确保农民的收益权和监督权，任何损害农民利益的行为都是法律所不允许的。其次，合作社在行使处分权时，还需考虑农村社会稳定和可持续发展的问题。土地不仅是农民的生产资料，更是农村社会稳定的基石，任何不当的处分行为都可能引发社会问题。

总结而言，用益物权处分权在农村土地流转中的应用，通过合作社模式实现了一种权利的再分配和集约化经营。在这一过程中，既要充分发挥用益物权的经济效益，又要严格限制其处分权的行使，确保农民的合法权益和社会稳定。合作社作为中介组织，在促进农村经济发展和保护农民权益方面，扮演着重要角色，其行为必须在法律框架内进行，确保各方利益的平衡与共赢。