在中国的土地制度中，宅基地是农村集体经济组织成员用于建造住宅及其附属设施的集体建设用地。《中华人民共和国宪法》第十条规定：“城市的土地属于国家所有。农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于集体所有；宅基地和自留地、自留山，也属于集体所有。”因此，宅基地的所有权归属于农民集体，而使用权则由符合条件的农户依法取得并享有。
根据《中华人民共和国民法典》第三百二十三条的规定：“用益物权人对他人所有的不动产或者动产，依法享有占有、使用和收益的权利。”这意味着宅基地的使用权人（即农户）对其使用的宅基地享有占有、使用和收益的权利。然而，当自然灾害导致宅基地灭失时，使用权人的用益物权将面临挑战。
为了保障使用权人的用益物权，中国制定了一系列法律法规和政策措施。例如，《中华人民共和国土地管理法》第四十条规定：“因抢险救灾、防汛需要紧急占用农用地的，依照法律规定办理审批手续；其中，涉及占用基本农田的，按照国务院的规定执行。”这表明，在面对自然灾害时，政府有权采取必要的应急措施，包括临时征用宅基地等土地资源，但必须遵守法定程序，并在事后及时给予补偿。
此外，《中华人民共和国侵权责任法》第二十九条规定：“因不可抗力造成他人损害的，不承担责任。法律另有规定的，依照其规定。”该条款明确了在发生自然灾害的情况下，如果造成了他人财产损失，通常情况下行为人不承担民事责任。但是，如果存在特殊情况或法律规定的行为应当承担责任，那么责任人仍需承担相应的法律责任。
在实际生活中，由于自然灾害导致宅基地灭失的情况并不罕见。例如，2008年汶川地震后，大量房屋倒塌，其中包括许多宅基地上的建筑物。面对这种情况，政府和相关部门采取了以下措施来保障使用权人的权益：
- 提供重建援助：政府向受灾群众提供了资金、物资和技术等方面的支持，帮助他们重新建造住房。
- 调整规划布局：对灾区进行了重新规划和设计，确保新建的宅基地更加安全可靠，符合防震要求。
- 实施优惠政策：对于受灾严重的地区，实施了税收减免、贷款贴息等优惠政策，减轻了农户的重建负担。
- 建立健全保险机制：推动建立和完善农业保险体系，为包括宅基地在内的农业生产提供风险保障。
综上所述，虽然自然灾害可能导致宅基地灭失，但在现有法律框架下，通过政府的积极干预和社会各界的支持与帮助，可以有效保障使用权人的用益物权，使他们在遭受灾难后能尽快恢复正常生活秩序。
