在土地资源日益稀缺和城市化进程加速的背景下，农村集体经营性建设用地入市的探索与实践为盘活农村闲置土地、促进城乡融合发展提供了新的契机。然而，随之而来的用益物权纠纷以及相关的法律问题亟待我们深入探讨与解决。本文旨在对这一领域的相关法律问题和案例进行分析，并提出相应的对策和建议。

首先，我们需要明确的是，农村集体经营性建设用地是指在农村集体经济组织所属的土地中，可以用于工业、商业等经营性用途的建设用地。根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规的规定，这类土地的所有权属于农民集体所有，但使用权可以通过出租、转让等方式进行流转。在此过程中，可能会涉及到用益物权的设立、变更、终止等问题，从而引发一系列的法律纠纷。

其次，我们来分析一下常见的用益物权纠纷类型。第一类是关于土地使用权的争议，例如使用权归属不清、期限不明或者未经法定程序批准擅自改变土地用途等情况；第二类是与收益分配有关的纠纷，如土地流转过程中的租金支付、利益分成等问题；第三类则是涉及土地利用规划和管理的问题，包括违反规划许可、未取得合法手续就开发建设等行为。这些问题的产生往往是因为相关法律的执行力度不足或监管不到位所致。

针对上述问题，我们可以采取以下措施来加以防范和化解：一是加强立法工作，完善相关法律法规体系，确保土地流转有章可循；二是建立健全土地产权登记制度，明晰所有权和使用权的界限，减少因权利不清而产生的纠纷；三是加强对土地流转过程的监督和管理，规范交易流程，打击非法占地和不正当竞争行为；四是加大对农民权益的保护力度，通过教育培训提升他们的法律意识和自我保护能力。

综上所述，妥善处理农村集体经营性建设用地入市中的用益物权纠纷及法律问题是保障土地制度改革顺利推进的关键环节。只有通过不断完善法律体系、强化执法力度、提高社会公众的法律素养，才能有效维护各方合法权益，实现资源的优化配置和社会经济的可持续发展。